CUT&RUN

CUT&RUN signifie clivage sous les cibles et libération par nucléase. La technique mise au point par le laboratoire Henikoff offre une nouvelle approche pour étudier l'épigénétique. CUT&RUN introduit quelques modifications majeures pour éliminer les défauts inhérents à ChIP-seq. Il est simple à réaliser et intrinsèquement robuste, avec un bruit de fond extrêmement faible ne nécessitant qu'un dixième de la profondeur de séquençage du ChIP. CUT&RUN est rentable pour le profilage des facteurs de transcription et de la chromatine.

CUT&RUN - Mieux que ChIP-seq!

Commencez avec CUT&RUN

antibodies-online propose une gamme complète de produits pour CUT&RUN : sets CUT&RUN, anticorps validés pour CUT&RUN, pAG-MNase, billes magnétiques de Concanavalin A, anticorps de contrôle positif et négatif et plus encore. Notre anticorps secondaire ABIN101961 a été utilisé dans différents articles originaux pour CUT&RUN par S. Henikoff. Découvrez notre gamme de produits.

Pourquoi choisir les produits CUT&RUN d'antibodies-online.com?

Chez antibodies-online.com, nous avons pris conscience très tôt des grands avantages de la technologie CUT&RUN et nous y accordons une attention toute particulière. Nous travaillons intensivement sur des produits qui rendent cette méthode innovante encore plus efficace et plus facile. Nous mettons régulièrement nos résultats à disposition dans notre propre protocole CUT&RUN ainsi que dans des webinaires et des brochures.

Nos anticorps, sets et composants CUT&RUN vous offrent la plus haute qualité et fiabilité. Si vous avez des questions, n'hésitez pas à contacter notre expert CUT&RUN, le docteur Stefan Pellenz.

• Extensively validated products
• Components precisely matched to each other
• More and more antibodies validated for CUT&RUN
• Scientific support for questions and problems

Importance de la sélection des anticorps

Cibles référencées dans les publications CUT&RUN / CUT&Tag

D'après les travaux publiés, la majorité des antigènes pour une fragmentation ciblée de l'ADN génomique par CUT&RUN et CUT&Tag sont des modifications d'histones telles que le répresseur H3K27me3 ou H3K4me3 associé à des promoteurs actifs. D'autres protéines cibles sont des régulateurs de transcription comme les facteurs de transcription CTCF ou SALL4, des modificateurs de chromatine comme HDAC2 ou des protéines impliquées dans le métabolisme des acides nucléiques comme Pol II. La plupart des travaux ont été réalisés avec des échantillons d'origine humaine ou murine. Pour un certain nombre de ces cibles, nous proposons déjà des anticorps explicitement validés pour une utilisation dans les tests CUT&RUN.

Ressources supplémentaires liées à CUT&RUN

• antibodies-online CUT&RUN Protocol @ protocols.io
• CUT&RUN - Improved Method to Study Protein-DNA Interactions
• Discover our CUT&RUN Sets - Download Flyer
• CUT&Tag - Workflow, Advantages, Products

Références

1. Skene, Henikoff: "An efficient targeted nuclease strategy for high-resolution mapping of DNA binding sites." dans: eLife, Vol. 6, (2018) (PubMed).
2. Brahma, Henikoff: "RSC-Associated Subnucleosomes Define MNase-Sensitive Promoters in Yeast." dans: Molecular cell, Vol. 73, Issue 2, pp. 238-249.e3, (2019) (PubMed).
3. Meers, Bryson, Henikoff, Henikoff: "Improved CUT&RUN chromatin profiling tools." dans: eLife, Vol. 8, (2019) (PubMed).
4. Henikoff, Henikoff, Kaya-Okur, Ahmad: "Efficient chromatin accessibility mapping in situ by nucleosome-tethered tagmentation." dans: eLife, Vol. 9, (2020) (PubMed).