Remodelage de la chromatine
Notre ADN nucléosomal est exposé à des changements constants de structure, de composition et de positionnement des nucléosomes afin d'exposer des régions entières d'un chromosome ou de les rendre plutôt inaccessibles. Ce processus est appelé remodelage de la chromatine - le plus haut niveau de régulation de la transcription chez les eucaryotes.
Les modifications covalentes des histones par des enzymes spécifiques, et les complexes de remodelage de la chromatine dépendants de l'ATP qui déplacent, éjectent ou restructurent les nucléosomes sont responsables du remodelage de la chromatine. Le remodelage de la chromatine confère un rôle de régulation épigénétique dans plusieurs processus biologiques clés, par exemple la réparation des dommages à l'ADN ou l'apoptose.
Anti-corps pour le remodelage de la chromatine
Complexes covalents modificateurs d'histone
Des complexes protéiques spécifiques, comme les histones acétyltransférases (HAT), les désacétylases, les méthyltransférases et les kinases, connus sous le nom de complexes modificateurs d'histones catalysent l'ajout ou le retrait de divers éléments chimiques sur les histones. De telles modifications affectent l'affinité de liaison entre les histones et l'ADN, et donc le relâchement ou le resserrement de l'ADN condensé autour des histones, par exemple, la méthylation de résidus lysine spécifiques dans H3 et H4 entraîne une condensation supplémentaire de l'ADN autour des histones, et empêche ainsi la liaison des facteurs de transcription à l'ADN qui conduit à la répression des gènes. Au contraire, l'acétylation des histones relâche la condensation de la chromatine et expose l'ADN à la liaison des TF, ce qui entraîne une augmentation de l'expression des gènes.
.Remodelage de la chromatine dépendant de l'ATP
Il existe au moins cinq familles de remodelage de la chromatine chez les eucaryotes : SWI/SNF, ISWI, NuRD/Mi-2/CHD, INO80 et SWR1, les deux premiers remodeleurs étant très bien étudiés jusqu'à présent, notamment dans le modèle de la levure. Bien que tous les remodelateurs partagent un domaine ATPase commun, leurs fonctions sont spécifiques en fonction de plusieurs processus biologiques. Cela est dû au fait que chaque complexe remodelant possède des domaines protéiques uniques (hélicase, bromodomaine, etc.) dans leur région ATPase catalytique et possède également différentes sous-unités recrutées.
Il a été démontré que les remodeleurs de la famille ISWI jouent un rôle central dans l'assemblage de la chromatine après la réplication de l'ADN et le maintien des structures chromatiniennes d'ordre supérieur. Ils organisent le nucléosome en forme de faisceau approprié et créent un espacement égal entre les nucléosomes, alors que les remodeleurs SWI/SNF désordonnent les nucléosomes.
Les remodeleurs de la famille INO80 et SWI/SNF participent à la réparation des cassures double brin (DSB) de l'ADN et à la réparation des nucléotides par excision (NER) et jouent ainsi un rôle crucial dans la réponse aux dommages à l'ADN médiée par TP53. Les complexes de remodelage NuRD/Mi-2/CHD assurent principalement la répression transcriptionnelle dans le noyau et sont nécessaires au maintien de la pluripotence des cellules souches embryonnaires. Enzymes.
Réparation des dommages à l'ADN
La relaxation semble être initiée par PARP1, dont l'accumulation au niveau des lésions de l'ADN est à moitié terminée 1,6 seconde après l'apparition de ces dernières. Elle est rapidement suivie par l'accumulation du remodelage de la chromatine Alc1, qui possède un domaine de liaison à l'ADP-ribose, lui permettant d'être rapidement attiré par le produit de PARP1. L'action de PARP1 au site d'une cassure double brin permet le recrutement des deux enzymes de réparation de l'ADN MRE11 et NBS1. La relaxation initiale rapide de la chromatine lors d'un dommage à l'ADN (avec initiation rapide de la réparation de l'ADN) est suivie d'une lente recondensation, la chromatine retrouvant un état de compaction proche de son niveau de prédamage en 20 minutes environ....
Anticorps pour la réparation des dommages à l'ADN
Informations et produits connexes
Pathway de réparation des dommages causés à l'ADN
>References
- Cassani C. et al. Structurally distinct Mre11 domains mediate MRX functions in resection, end-tethering and DNA damage resistance. (2018) doi: 10.1093/nar/gky086
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